MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp36

Total Repeats: 442

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012204	CAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985708
2	NC_012204	ATA	2	6	716	721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985708
3	NC_012204	ATA	2	6	749	754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985708
4	NC_012204	ACA	3	9	776	784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985708
5	NC_012204	GAT	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985708
6	NC_012204	TAG	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
7	NC_012204	TGC	2	6	1288	1293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985709
8	NC_012204	ATG	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
9	NC_012204	AGA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985709
10	NC_012204	G	6	6	1382	1387	0 %	0 %	100 %	0 %	224985709
11	NC_012204	ATG	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
12	NC_012204	ATG	2	6	1425	1430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985709
13	NC_012204	AT	4	8	1533	1540	50 %	50 %	0 %	0 %	224985709
14	NC_012204	A	6	6	1541	1546	100 %	0 %	0 %	0 %	224985709
15	NC_012204	AAGTAA	2	12	1569	1580	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224985709
16	NC_012204	CT	3	6	1638	1643	0 %	50 %	0 %	50 %	224985710
17	NC_012204	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985710
18	NC_012204	ATT	2	6	1696	1701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
19	NC_012204	T	6	6	1700	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	224985710
20	NC_012204	ATT	2	6	1708	1713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
21	NC_012204	ATT	3	9	1753	1761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
22	NC_012204	ATT	2	6	1771	1776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985710
23	NC_012204	TA	3	6	1780	1785	50 %	50 %	0 %	0 %	224985710
24	NC_012204	TAA	2	6	1840	1845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
25	NC_012204	TAT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985711
26	NC_012204	T	7	7	1882	1888	0 %	100 %	0 %	0 %	224985711
27	NC_012204	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985711
28	NC_012204	TCTA	2	8	1910	1917	25 %	50 %	0 %	25 %	224985711
29	NC_012204	A	6	6	1917	1922	100 %	0 %	0 %	0 %	224985711
30	NC_012204	GCATTA	2	12	1938	1949	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224985711
31	NC_012204	ATC	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
32	NC_012204	A	8	8	1968	1975	100 %	0 %	0 %	0 %	224985711
33	NC_012204	TAC	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
34	NC_012204	CAT	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
35	NC_012204	A	7	7	2046	2052	100 %	0 %	0 %	0 %	224985711
36	NC_012204	GAT	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985711
37	NC_012204	ATA	2	6	2113	2118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
38	NC_012204	AAT	2	6	2147	2152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
39	NC_012204	AAT	2	6	2175	2180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985711
40	NC_012204	GAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985711
41	NC_012204	TAC	2	6	2255	2260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985711
42	NC_012204	AAG	3	9	2287	2295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985711
43	NC_012204	A	7	7	2442	2448	100 %	0 %	0 %	0 %	224985712
44	NC_012204	TAT	2	6	2458	2463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985712
45	NC_012204	TCTAA	2	10	2466	2475	40 %	40 %	0 %	20 %	224985712
46	NC_012204	AGCA	2	8	2557	2564	50 %	0 %	25 %	25 %	224985712
47	NC_012204	AT	3	6	2748	2753	50 %	50 %	0 %	0 %	224985712
48	NC_012204	GTTA	2	8	2764	2771	25 %	50 %	25 %	0 %	224985712
49	NC_012204	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985713
50	NC_012204	AGC	3	9	3338	3346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985713
51	NC_012204	TCT	2	6	3419	3424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985713
52	NC_012204	AGA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
53	NC_012204	ATAAA	2	10	3480	3489	80 %	20 %	0 %	0 %	224985713
54	NC_012204	CTTA	2	8	3493	3500	25 %	50 %	0 %	25 %	224985713
55	NC_012204	AGA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
56	NC_012204	GCCTA	2	10	3571	3580	20 %	20 %	20 %	40 %	224985713
57	NC_012204	CTG	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985713
58	NC_012204	ATG	2	6	3636	3641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985713
59	NC_012204	TGC	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985713
60	NC_012204	AGA	2	6	3709	3714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985713
61	NC_012204	CTA	3	9	3751	3759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985713
62	NC_012204	ACC	2	6	3768	3773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224985713
63	NC_012204	AGT	2	6	3803	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985713
64	NC_012204	AT	4	8	3900	3907	50 %	50 %	0 %	0 %	224985713
65	NC_012204	A	6	6	3908	3913	100 %	0 %	0 %	0 %	224985713
66	NC_012204	AAGTAA	2	12	3936	3947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	224985713
67	NC_012204	CT	3	6	4005	4010	0 %	50 %	0 %	50 %	224985714
68	NC_012204	ACA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985714
69	NC_012204	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
70	NC_012204	T	6	6	4067	4072	0 %	100 %	0 %	0 %	224985714
71	NC_012204	ATT	2	6	4075	4080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
72	NC_012204	ATT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
73	NC_012204	ATT	2	6	4138	4143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985714
74	NC_012204	TA	3	6	4147	4152	50 %	50 %	0 %	0 %	224985714
75	NC_012204	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
76	NC_012204	TAT	2	6	4220	4225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
77	NC_012204	T	7	7	4249	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	224985715
78	NC_012204	GTT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985715
79	NC_012204	TCTA	2	8	4277	4284	25 %	50 %	0 %	25 %	224985715
80	NC_012204	A	6	6	4284	4289	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
81	NC_012204	GCATTA	2	12	4305	4316	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	224985715
82	NC_012204	ATC	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
83	NC_012204	A	8	8	4335	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
84	NC_012204	TAC	2	6	4343	4348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
85	NC_012204	CAT	2	6	4402	4407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985715
86	NC_012204	A	7	7	4413	4419	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
87	NC_012204	GAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985715
88	NC_012204	ATA	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
89	NC_012204	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
90	NC_012204	AAT	2	6	4542	4547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985715
91	NC_012204	GAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985715
92	NC_012204	CAA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985715
93	NC_012204	AGA	3	9	4655	4663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985715
94	NC_012204	TTA	2	6	4824	4829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
95	NC_012204	TAT	2	6	4874	4879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985715
96	NC_012204	AGCA	2	8	4912	4919	50 %	0 %	25 %	25 %	224985715
97	NC_012204	A	6	6	5057	5062	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
98	NC_012204	TGCA	2	8	5093	5100	25 %	25 %	25 %	25 %	224985715
99	NC_012204	A	6	6	5151	5156	100 %	0 %	0 %	0 %	224985715
100	NC_012204	AT	3	6	5167	5172	50 %	50 %	0 %	0 %	224985715
101	NC_012204	ATT	2	6	5455	5460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224985716
102	NC_012204	CT	3	6	5495	5500	0 %	50 %	0 %	50 %	224985716
103	NC_012204	ACA	2	6	5556	5561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985716
104	NC_012204	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985716
105	NC_012204	AGC	2	6	5585	5590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985716
106	NC_012204	AAT	2	6	5624	5629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985716
107	NC_012204	AAACA	2	10	5639	5648	80 %	0 %	0 %	20 %	224985716
108	NC_012204	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224985716
109	NC_012204	ATA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985716
110	NC_012204	AGC	2	6	5696	5701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224985716
111	NC_012204	CAA	2	6	5711	5716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985716
112	NC_012204	TCT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985716
113	NC_012204	AGA	2	6	5782	5787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985716
114	NC_012204	GCTT	2	8	5846	5853	0 %	50 %	25 %	25 %	224985717
115	NC_012204	AGT	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985717
116	NC_012204	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224985717
117	NC_012204	ATG	2	6	5990	5995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224985717
118	NC_012204	TAAA	2	8	6228	6235	75 %	25 %	0 %	0 %	224985718
119	NC_012204	GCT	2	6	6245	6250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224985718
120	NC_012204	AAG	2	6	6421	6426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
121	NC_012204	CAA	2	6	6495	6500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
122	NC_012204	TAA	3	9	6524	6532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
123	NC_012204	ACA	2	6	6547	6552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
124	NC_012204	AAG	2	6	6554	6559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
125	NC_012204	AAT	2	6	6597	6602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
126	NC_012204	AAT	2	6	6612	6617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
127	NC_012204	AAG	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
128	NC_012204	A	6	6	6648	6653	100 %	0 %	0 %	0 %	224985719
129	NC_012204	AAT	2	6	6657	6662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
130	NC_012204	CAA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224985719
131	NC_012204	TAA	3	9	6755	6763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
132	NC_012204	CAT	2	6	6791	6796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224985719
133	NC_012204	AGA	2	6	6818	6823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224985719
134	NC_012204	TAA	2	6	6827	6832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
135	NC_012204	TAA	2	6	6869	6874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224985719
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